减毒活疫苗不太稳定，主要其原理是没有完全杀死毒株，只做了减少毒性处理，所以安全性比灭活疫苗更差，而灭活疫苗就是将乙脑病毒完全杀死，接种后儿童的免疫系统产生相应的抗体，但效果又比减毒差，所以打哪个好需要宝妈自行抉择。
灭活疫苗原理是直接杀死病毒
部分免疫力差的宝宝在接种减毒活疫苗后可能出现严重的不良反应，甚至会对儿童的身体造成不可逆的伤害，这类儿童选择灭活疫苗就更为合适，所以宝妈在给自己孩子注射前需要详细咨询医生帮助你做出更好的选择。
此外这两种乙脑疫苗的接种时间有所差异，减毒活是在宝宝8个月大开始注射第一针，等到2岁接种第二针，灭活疫苗的第一针与前者相同，第二次注射时间隔7周，第三四次接种时间分别是在宝宝4岁和6岁。
两者接种次数有差异
相较于灭活疫苗，孩子接种减毒活持续时间更久，在打完基两针后保证率达到90%以上，而灭活疫苗的保证率只有60%-80%，并不能100%保证孩子的安全，所以平时也要注意做好病毒的防范。
但有一点要注意的是并不是两个都要打，部分家长在注射灭活疫苗基础两针后给孩子接种减毒活，这完全是没有必要的，宝宝的适应能力差，突然改变疫苗种类会对身体造成伤害。
乙脑疫苗接种的禁忌人群
先天性过敏人群;
有严重肺炎、肝肾疾病患者;
接种前感冒发烧等急性疾病;
脑及神经系统疾病人群。
除开上诉人群禁止接种，其他儿童就必须给孩子注射，毕竟乙型脑炎的危害很大，严重者甚至影响儿童的脑神经发育，导致出现痴呆、反应迟缓等症状。